Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y256

RCE1, CAAX prenyl protease 2, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCE1Q9Y256 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RCE1Q9Y256 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RCE1Q9Y256 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RCE1Q9Y256 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RCE1Q9Y256 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RCE1Q9Y256 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RCE1Q9Y256 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RCE1Q9Y256 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RCE1Q9Y256 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RCE1Q9Y256 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RCE1Q9Y256 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RCE1Q9Y256 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RCE1Q9Y256 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RCE1Q9Y256 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RCE1Q9Y256 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RCE1Q9Y256 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RCE1Q9Y256 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RCE1Q9Y256 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RCE1Q9Y256 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RCE1Q9Y256 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RCE1Q9Y256 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RCE1Q9Y256 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RCE1Q9Y256 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RCE1Q9Y256 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RCE1Q9Y256 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RCE1Q9Y256 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RCE1Q9Y256 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RCE1Q9Y256 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RCE1Q9Y256 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RCE1Q9Y256 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RCE1Q9Y256 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RCE1Q9Y256 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
RCE1Q9Y256 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RCE1Q9Y256 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RCE1Q9Y256 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RCE1Q9Y256 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RCE1Q9Y256 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RCE1Q9Y256 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RCE1Q9Y256 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RCE1Q9Y256 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RCE1Q9Y256 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RCE1Q9Y256 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RCE1Q9Y256 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RCE1Q9Y256 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RCE1Q9Y256 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RCE1Q9Y256 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RCE1Q9Y256 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RCE1Q9Y256 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RCE1Q9Y256 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RCE1Q9Y256 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RCE1Q9Y256 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
RCE1Q9Y256 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RCE1Q9Y256 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RCE1Q9Y256 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
RCE1Q9Y256 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
RCE1Q9Y256 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RCE1Q9Y256 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RCE1Q9Y256 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
RCE1Q9Y256 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RCE1Q9Y256 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RCE1Q9Y256 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RCE1Q9Y256 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RCE1Q9Y256 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RCE1Q9Y256 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RCE1Q9Y256 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RCE1Q9Y256 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RCE1Q9Y256 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RCE1Q9Y256 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RCE1Q9Y256 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RCE1Q9Y256 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RCE1Q9Y256 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RCE1Q9Y256 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RCE1Q9Y256 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RCE1Q9Y256 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RCE1Q9Y256 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RCE1Q9Y256 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RCE1Q9Y256 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RCE1Q9Y256 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
RCE1Q9Y256 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RCE1Q9Y256 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RCE1Q9Y256 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RCE1Q9Y256 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RCE1Q9Y256 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RCE1Q9Y256 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RCE1Q9Y256 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RCE1Q9Y256 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RCE1Q9Y256 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RCE1Q9Y256 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RCE1Q9Y256 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RCE1Q9Y256 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RCE1Q9Y256 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RCE1Q9Y256 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RCE1Q9Y256 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RCE1Q9Y256 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RCE1Q9Y256 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RCE1Q9Y256 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RCE1Q9Y256 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RCE1Q9Y256 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RCE1Q9Y256 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
RCE1Q9Y256 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.5 ms