Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

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Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SHOC2Q9UQ13 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SHOC2Q9UQ13 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SHOC2Q9UQ13 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SHOC2Q9UQ13 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SHOC2Q9UQ13 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SHOC2Q9UQ13 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SHOC2Q9UQ13 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SHOC2Q9UQ13 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SHOC2Q9UQ13 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SHOC2Q9UQ13 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SHOC2Q9UQ13 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SHOC2Q9UQ13 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SHOC2Q9UQ13 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SHOC2Q9UQ13 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SHOC2Q9UQ13 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SHOC2Q9UQ13 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SHOC2Q9UQ13 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SHOC2Q9UQ13 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHOC2Q9UQ13 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHOC2Q9UQ13 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHOC2Q9UQ13 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHOC2Q9UQ13 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHOC2Q9UQ13 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHOC2Q9UQ13 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHOC2Q9UQ13 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHOC2Q9UQ13 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHOC2Q9UQ13 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SHOC2Q9UQ13 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHOC2Q9UQ13 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHOC2Q9UQ13 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHOC2Q9UQ13 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHOC2Q9UQ13 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHOC2Q9UQ13 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHOC2Q9UQ13 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHOC2Q9UQ13 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHOC2Q9UQ13 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHOC2Q9UQ13 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHOC2Q9UQ13 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHOC2Q9UQ13 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHOC2Q9UQ13 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SHOC2Q9UQ13 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHOC2Q9UQ13 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHOC2Q9UQ13 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SHOC2Q9UQ13 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHOC2Q9UQ13 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHOC2Q9UQ13 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHOC2Q9UQ13 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHOC2Q9UQ13 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHOC2Q9UQ13 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHOC2Q9UQ13 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHOC2Q9UQ13 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHOC2Q9UQ13 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHOC2Q9UQ13 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHOC2Q9UQ13 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHOC2Q9UQ13 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHOC2Q9UQ13 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHOC2Q9UQ13 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHOC2Q9UQ13 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SHOC2Q9UQ13 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHOC2Q9UQ13 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHOC2Q9UQ13 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHOC2Q9UQ13 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHOC2Q9UQ13 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHOC2Q9UQ13 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHOC2Q9UQ13 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHOC2Q9UQ13 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHOC2Q9UQ13 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHOC2Q9UQ13 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHOC2Q9UQ13 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHOC2Q9UQ13 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHOC2Q9UQ13 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHOC2Q9UQ13 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHOC2Q9UQ13 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHOC2Q9UQ13 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHOC2Q9UQ13 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHOC2Q9UQ13 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHOC2Q9UQ13 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHOC2Q9UQ13 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHOC2Q9UQ13 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHOC2Q9UQ13 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SHOC2Q9UQ13 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHOC2Q9UQ13 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHOC2Q9UQ13 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHOC2Q9UQ13 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHOC2Q9UQ13 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHOC2Q9UQ13 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHOC2Q9UQ13 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHOC2Q9UQ13 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHOC2Q9UQ13 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHOC2Q9UQ13 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHOC2Q9UQ13 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHOC2Q9UQ13 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHOC2Q9UQ13 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHOC2Q9UQ13 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHOC2Q9UQ13 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHOC2Q9UQ13 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHOC2Q9UQ13 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHOC2Q9UQ13 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHOC2Q9UQ13 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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