Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP3

USP25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, humanhuman

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Length 1,055 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25Q9UHP3 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP25Q9UHP3 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP25Q9UHP3 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP25Q9UHP3 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP25Q9UHP3 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP25Q9UHP3 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP25Q9UHP3 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP25Q9UHP3 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP25Q9UHP3 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
USP25Q9UHP3 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP25Q9UHP3 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP25Q9UHP3 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
USP25Q9UHP3 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
USP25Q9UHP3 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
USP25Q9UHP3 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
USP25Q9UHP3 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
USP25Q9UHP3 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP25Q9UHP3 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP25Q9UHP3 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP25Q9UHP3 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP25Q9UHP3 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP25Q9UHP3 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP25Q9UHP3 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP25Q9UHP3 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP25Q9UHP3 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
USP25Q9UHP3 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP25Q9UHP3 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP25Q9UHP3 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP25Q9UHP3 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP25Q9UHP3 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
USP25Q9UHP3 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP25Q9UHP3 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP25Q9UHP3 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP25Q9UHP3 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP25Q9UHP3 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP25Q9UHP3 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP25Q9UHP3 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP25Q9UHP3 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP25Q9UHP3 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP25Q9UHP3 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP25Q9UHP3 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP25Q9UHP3 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP25Q9UHP3 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP25Q9UHP3 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP25Q9UHP3 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP25Q9UHP3 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP25Q9UHP3 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP25Q9UHP3 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP25Q9UHP3 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP25Q9UHP3 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP25Q9UHP3 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP25Q9UHP3 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP25Q9UHP3 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP25Q9UHP3 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP25Q9UHP3 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP25Q9UHP3 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP25Q9UHP3 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP25Q9UHP3 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP25Q9UHP3 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP25Q9UHP3 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP25Q9UHP3 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP25Q9UHP3 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP25Q9UHP3 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP25Q9UHP3 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP25Q9UHP3 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP25Q9UHP3 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP25Q9UHP3 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP25Q9UHP3 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP25Q9UHP3 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP25Q9UHP3 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP25Q9UHP3 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP25Q9UHP3 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP25Q9UHP3 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
USP25Q9UHP3 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP25Q9UHP3 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP25Q9UHP3 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP25Q9UHP3 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP25Q9UHP3 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP25Q9UHP3 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP25Q9UHP3 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP25Q9UHP3 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP25Q9UHP3 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP25Q9UHP3 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP25Q9UHP3 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP25Q9UHP3 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP25Q9UHP3 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP25Q9UHP3 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP25Q9UHP3 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
USP25Q9UHP3 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
USP25Q9UHP3 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP25Q9UHP3 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP25Q9UHP3 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP25Q9UHP3 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP25Q9UHP3 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP25Q9UHP3 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP25Q9UHP3 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP25Q9UHP3 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP25Q9UHP3 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP25Q9UHP3 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP25Q9UHP3 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
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