Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2V4

LRIT1, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 623 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIT1Q9P2V4 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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