Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K1

CC2D2A, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D2AQ9P2K1 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CC2D2AQ9P2K1 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CC2D2AQ9P2K1 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CC2D2AQ9P2K1 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CC2D2AQ9P2K1 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CC2D2AQ9P2K1 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CC2D2AQ9P2K1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CC2D2AQ9P2K1 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CC2D2AQ9P2K1 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CC2D2AQ9P2K1 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CC2D2AQ9P2K1 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.24
CC2D2AQ9P2K1 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CC2D2AQ9P2K1 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CC2D2AQ9P2K1 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CC2D2AQ9P2K1 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CC2D2AQ9P2K1 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CC2D2AQ9P2K1 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CC2D2AQ9P2K1 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CC2D2AQ9P2K1 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CC2D2AQ9P2K1 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CC2D2AQ9P2K1 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CC2D2AQ9P2K1 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CC2D2AQ9P2K1 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CC2D2AQ9P2K1 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CC2D2AQ9P2K1 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CC2D2AQ9P2K1 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CC2D2AQ9P2K1 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CC2D2AQ9P2K1 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CC2D2AQ9P2K1 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CC2D2AQ9P2K1 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CC2D2AQ9P2K1 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
CC2D2AQ9P2K1 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CC2D2AQ9P2K1 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CC2D2AQ9P2K1 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CC2D2AQ9P2K1 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
CC2D2AQ9P2K1 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
CC2D2AQ9P2K1 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CC2D2AQ9P2K1 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CC2D2AQ9P2K1 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CC2D2AQ9P2K1 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CC2D2AQ9P2K1 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CC2D2AQ9P2K1 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
CC2D2AQ9P2K1 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CC2D2AQ9P2K1 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CC2D2AQ9P2K1 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CC2D2AQ9P2K1 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
CC2D2AQ9P2K1 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CC2D2AQ9P2K1 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CC2D2AQ9P2K1 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CC2D2AQ9P2K1 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CC2D2AQ9P2K1 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CC2D2AQ9P2K1 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CC2D2AQ9P2K1 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CC2D2AQ9P2K1 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CC2D2AQ9P2K1 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CC2D2AQ9P2K1 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CC2D2AQ9P2K1 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CC2D2AQ9P2K1 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CC2D2AQ9P2K1 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CC2D2AQ9P2K1 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CC2D2AQ9P2K1 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CC2D2AQ9P2K1 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CC2D2AQ9P2K1 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CC2D2AQ9P2K1 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CC2D2AQ9P2K1 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CC2D2AQ9P2K1 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
CC2D2AQ9P2K1 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CC2D2AQ9P2K1 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CC2D2AQ9P2K1 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CC2D2AQ9P2K1 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
CC2D2AQ9P2K1 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CC2D2AQ9P2K1 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
CC2D2AQ9P2K1 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CC2D2AQ9P2K1 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CC2D2AQ9P2K1 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CC2D2AQ9P2K1 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CC2D2AQ9P2K1 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CC2D2AQ9P2K1 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CC2D2AQ9P2K1 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CC2D2AQ9P2K1 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CC2D2AQ9P2K1 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CC2D2AQ9P2K1 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CC2D2AQ9P2K1 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CC2D2AQ9P2K1 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CC2D2AQ9P2K1 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CC2D2AQ9P2K1 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CC2D2AQ9P2K1 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CC2D2AQ9P2K1 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CC2D2AQ9P2K1 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CC2D2AQ9P2K1 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CC2D2AQ9P2K1 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CC2D2AQ9P2K1 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
CC2D2AQ9P2K1 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CC2D2AQ9P2K1 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CC2D2AQ9P2K1 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CC2D2AQ9P2K1 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CC2D2AQ9P2K1 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CC2D2AQ9P2K1 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CC2D2AQ9P2K1 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CC2D2AQ9P2K1 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms