Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS3

KLHL28, Kelch-like protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL28Q9NXS3 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms