Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX36

DNAJC28, DnaJ homolog subfamily C member 28, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC28Q9NX36 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms