Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWF4

SLC52A1, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 1, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A1Q9NWF4 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC52A1Q9NWF4 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC52A1Q9NWF4 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC52A1Q9NWF4 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC52A1Q9NWF4 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms