Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR7

TBCCD1, TBCC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBCCD1Q9NVR7 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms