Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSU2

TREX1, Three-prime repair exonuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX1Q9NSU2 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TREX1Q9NSU2 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TREX1Q9NSU2 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TREX1Q9NSU2 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TREX1Q9NSU2 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TREX1Q9NSU2 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TREX1Q9NSU2 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TREX1Q9NSU2 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TREX1Q9NSU2 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TREX1Q9NSU2 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TREX1Q9NSU2 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TREX1Q9NSU2 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TREX1Q9NSU2 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TREX1Q9NSU2 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TREX1Q9NSU2 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TREX1Q9NSU2 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TREX1Q9NSU2 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TREX1Q9NSU2 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TREX1Q9NSU2 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TREX1Q9NSU2 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TREX1Q9NSU2 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TREX1Q9NSU2 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TREX1Q9NSU2 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TREX1Q9NSU2 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TREX1Q9NSU2 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TREX1Q9NSU2 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TREX1Q9NSU2 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TREX1Q9NSU2 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TREX1Q9NSU2 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TREX1Q9NSU2 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TREX1Q9NSU2 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TREX1Q9NSU2 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TREX1Q9NSU2 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TREX1Q9NSU2 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TREX1Q9NSU2 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TREX1Q9NSU2 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TREX1Q9NSU2 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TREX1Q9NSU2 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TREX1Q9NSU2 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TREX1Q9NSU2 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TREX1Q9NSU2 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TREX1Q9NSU2 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TREX1Q9NSU2 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TREX1Q9NSU2 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TREX1Q9NSU2 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TREX1Q9NSU2 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TREX1Q9NSU2 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TREX1Q9NSU2 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TREX1Q9NSU2 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TREX1Q9NSU2 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TREX1Q9NSU2 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TREX1Q9NSU2 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TREX1Q9NSU2 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TREX1Q9NSU2 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TREX1Q9NSU2 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TREX1Q9NSU2 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TREX1Q9NSU2 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TREX1Q9NSU2 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TREX1Q9NSU2 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TREX1Q9NSU2 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TREX1Q9NSU2 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TREX1Q9NSU2 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TREX1Q9NSU2 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TREX1Q9NSU2 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TREX1Q9NSU2 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TREX1Q9NSU2 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TREX1Q9NSU2 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TREX1Q9NSU2 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TREX1Q9NSU2 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TREX1Q9NSU2 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TREX1Q9NSU2 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TREX1Q9NSU2 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TREX1Q9NSU2 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TREX1Q9NSU2 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TREX1Q9NSU2 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TREX1Q9NSU2 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TREX1Q9NSU2 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TREX1Q9NSU2 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TREX1Q9NSU2 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms