Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR5

UBQLN4, Ubiquilin-4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN4Q9NRR5 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBQLN4Q9NRR5 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBQLN4Q9NRR5 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBQLN4Q9NRR5 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBQLN4Q9NRR5 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBQLN4Q9NRR5 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBQLN4Q9NRR5 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBQLN4Q9NRR5 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBQLN4Q9NRR5 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBQLN4Q9NRR5 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBQLN4Q9NRR5 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBQLN4Q9NRR5 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBQLN4Q9NRR5 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBQLN4Q9NRR5 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBQLN4Q9NRR5 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBQLN4Q9NRR5 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBQLN4Q9NRR5 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
UBQLN4Q9NRR5 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBQLN4Q9NRR5 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBQLN4Q9NRR5 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBQLN4Q9NRR5 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
UBQLN4Q9NRR5 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBQLN4Q9NRR5 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
UBQLN4Q9NRR5 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBQLN4Q9NRR5 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBQLN4Q9NRR5 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
UBQLN4Q9NRR5 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBQLN4Q9NRR5 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBQLN4Q9NRR5 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBQLN4Q9NRR5 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBQLN4Q9NRR5 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBQLN4Q9NRR5 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBQLN4Q9NRR5 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBQLN4Q9NRR5 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBQLN4Q9NRR5 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBQLN4Q9NRR5 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBQLN4Q9NRR5 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBQLN4Q9NRR5 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBQLN4Q9NRR5 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBQLN4Q9NRR5 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBQLN4Q9NRR5 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBQLN4Q9NRR5 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBQLN4Q9NRR5 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBQLN4Q9NRR5 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBQLN4Q9NRR5 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBQLN4Q9NRR5 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBQLN4Q9NRR5 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBQLN4Q9NRR5 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBQLN4Q9NRR5 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBQLN4Q9NRR5 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBQLN4Q9NRR5 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBQLN4Q9NRR5 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBQLN4Q9NRR5 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBQLN4Q9NRR5 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBQLN4Q9NRR5 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBQLN4Q9NRR5 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBQLN4Q9NRR5 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBQLN4Q9NRR5 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBQLN4Q9NRR5 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBQLN4Q9NRR5 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBQLN4Q9NRR5 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBQLN4Q9NRR5 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBQLN4Q9NRR5 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBQLN4Q9NRR5 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBQLN4Q9NRR5 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBQLN4Q9NRR5 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBQLN4Q9NRR5 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBQLN4Q9NRR5 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
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