Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHST12Q9NRB3 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHST12Q9NRB3 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHST12Q9NRB3 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHST12Q9NRB3 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHST12Q9NRB3 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHST12Q9NRB3 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHST12Q9NRB3 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHST12Q9NRB3 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHST12Q9NRB3 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHST12Q9NRB3 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHST12Q9NRB3 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHST12Q9NRB3 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHST12Q9NRB3 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHST12Q9NRB3 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHST12Q9NRB3 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHST12Q9NRB3 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHST12Q9NRB3 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHST12Q9NRB3 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHST12Q9NRB3 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHST12Q9NRB3 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHST12Q9NRB3 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHST12Q9NRB3 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CHST12Q9NRB3 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CHST12Q9NRB3 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CHST12Q9NRB3 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHST12Q9NRB3 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHST12Q9NRB3 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CHST12Q9NRB3 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHST12Q9NRB3 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHST12Q9NRB3 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHST12Q9NRB3 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHST12Q9NRB3 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHST12Q9NRB3 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHST12Q9NRB3 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHST12Q9NRB3 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CHST12Q9NRB3 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHST12Q9NRB3 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHST12Q9NRB3 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHST12Q9NRB3 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHST12Q9NRB3 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CHST12Q9NRB3 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHST12Q9NRB3 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHST12Q9NRB3 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHST12Q9NRB3 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHST12Q9NRB3 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHST12Q9NRB3 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHST12Q9NRB3 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHST12Q9NRB3 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHST12Q9NRB3 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHST12Q9NRB3 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHST12Q9NRB3 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHST12Q9NRB3 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHST12Q9NRB3 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHST12Q9NRB3 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHST12Q9NRB3 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHST12Q9NRB3 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHST12Q9NRB3 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHST12Q9NRB3 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHST12Q9NRB3 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHST12Q9NRB3 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CHST12Q9NRB3 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHST12Q9NRB3 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHST12Q9NRB3 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CHST12Q9NRB3 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHST12Q9NRB3 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHST12Q9NRB3 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHST12Q9NRB3 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHST12Q9NRB3 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CHST12Q9NRB3 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHST12Q9NRB3 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CHST12Q9NRB3 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CHST12Q9NRB3 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHST12Q9NRB3 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CHST12Q9NRB3 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CHST12Q9NRB3 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CHST12Q9NRB3 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHST12Q9NRB3 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHST12Q9NRB3 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHST12Q9NRB3 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHST12Q9NRB3 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHST12Q9NRB3 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHST12Q9NRB3 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHST12Q9NRB3 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHST12Q9NRB3 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHST12Q9NRB3 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHST12Q9NRB3 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHST12Q9NRB3 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHST12Q9NRB3 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHST12Q9NRB3 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHST12Q9NRB3 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHST12Q9NRB3 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHST12Q9NRB3 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHST12Q9NRB3 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHST12Q9NRB3 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHST12Q9NRB3 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHST12Q9NRB3 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHST12Q9NRB3 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHST12Q9NRB3 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHST12Q9NRB3 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms