Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NRIP3Q9NQ35 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NRIP3Q9NQ35 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
NRIP3Q9NQ35 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NRIP3Q9NQ35 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
NRIP3Q9NQ35 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NRIP3Q9NQ35 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NRIP3Q9NQ35 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NRIP3Q9NQ35 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NRIP3Q9NQ35 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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NRIP3Q9NQ35 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NRIP3Q9NQ35 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
NRIP3Q9NQ35 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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NRIP3Q9NQ35 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NRIP3Q9NQ35 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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NRIP3Q9NQ35 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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NRIP3Q9NQ35 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NRIP3Q9NQ35 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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NRIP3Q9NQ35 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NRIP3Q9NQ35 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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NRIP3Q9NQ35 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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NRIP3Q9NQ35 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NRIP3Q9NQ35 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NRIP3Q9NQ35 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
NRIP3Q9NQ35 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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NRIP3Q9NQ35 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NRIP3Q9NQ35 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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NRIP3Q9NQ35 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NRIP3Q9NQ35 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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NRIP3Q9NQ35 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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NRIP3Q9NQ35 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
NRIP3Q9NQ35 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NRIP3Q9NQ35 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
NRIP3Q9NQ35 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
NRIP3Q9NQ35 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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