Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP91

SLC6A20, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A20Q9NP91 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms