Protein–RNA interactions for Protein: Q9HDB9

ERVK-5, Endogenous retrovirus group K member 5 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-5Q9HDB9 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms