Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT3

SLIRP, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIRPQ9GZT3 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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