Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms