Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.4 ms