Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms