Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR8

KRTAP3-1, Keratin-associated protein 3-1, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP3-1Q9BYR8 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
KRTAP3-1Q9BYR8 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
KRTAP3-1Q9BYR8 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
KRTAP3-1Q9BYR8 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
KRTAP3-1Q9BYR8 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC8.47□□□□□ -1.05
KRTAP3-1Q9BYR8 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
KRTAP3-1Q9BYR8 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
KRTAP3-1Q9BYR8 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC8.47□□□□□ -1.05
KRTAP3-1Q9BYR8 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
KRTAP3-1Q9BYR8 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
KRTAP3-1Q9BYR8 LINC01221-201ENST00000432488 662 ntTSL 3 BASIC8.47□□□□□ -1.05
KRTAP3-1Q9BYR8 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
KRTAP3-1Q9BYR8 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
KRTAP3-1Q9BYR8 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC8.47□□□□□ -1.05
KRTAP3-1Q9BYR8 KCTD14-202ENST00000533144 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
KRTAP3-1Q9BYR8 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC8.47□□□□□ -1.05
KRTAP3-1Q9BYR8 AL096869.2-202ENST00000557007 1237 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
KRTAP3-1Q9BYR8 ST20-203ENST00000562759 694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
KRTAP3-1Q9BYR8 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC8.47□□□□□ -1.05
KRTAP3-1Q9BYR8 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.47□□□□□ -1.05
KRTAP3-1Q9BYR8 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
KRTAP3-1Q9BYR8 RPAP2P1-201ENST00000603626 1168 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
KRTAP3-1Q9BYR8 AC004908.3-201ENST00000610248 625 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
KRTAP3-1Q9BYR8 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
KRTAP3-1Q9BYR8 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC8.47□□□□□ -1.05
KRTAP3-1Q9BYR8 FGA-203ENST00000622532 1130 ntTSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
KRTAP3-1Q9BYR8 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
KRTAP3-1Q9BYR8 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
KRTAP3-1Q9BYR8 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
KRTAP3-1Q9BYR8 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
KRTAP3-1Q9BYR8 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
KRTAP3-1Q9BYR8 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
KRTAP3-1Q9BYR8 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
KRTAP3-1Q9BYR8 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
KRTAP3-1Q9BYR8 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
KRTAP3-1Q9BYR8 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
KRTAP3-1Q9BYR8 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
KRTAP3-1Q9BYR8 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
KRTAP3-1Q9BYR8 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
KRTAP3-1Q9BYR8 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
KRTAP3-1Q9BYR8 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
KRTAP3-1Q9BYR8 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
KRTAP3-1Q9BYR8 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
KRTAP3-1Q9BYR8 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
KRTAP3-1Q9BYR8 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
KRTAP3-1Q9BYR8 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
KRTAP3-1Q9BYR8 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
KRTAP3-1Q9BYR8 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC8.47□□□□□ -1.05
KRTAP3-1Q9BYR8 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC8.47□□□□□ -1.05
KRTAP3-1Q9BYR8 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
KRTAP3-1Q9BYR8 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
KRTAP3-1Q9BYR8 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
KRTAP3-1Q9BYR8 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
KRTAP3-1Q9BYR8 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
KRTAP3-1Q9BYR8 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
KRTAP3-1Q9BYR8 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.05
KRTAP3-1Q9BYR8 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
KRTAP3-1Q9BYR8 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
KRTAP3-1Q9BYR8 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.05
KRTAP3-1Q9BYR8 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
KRTAP3-1Q9BYR8 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.05
KRTAP3-1Q9BYR8 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.05
KRTAP3-1Q9BYR8 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC8.46□□□□□ -1.05
KRTAP3-1Q9BYR8 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC8.46□□□□□ -1.05
KRTAP3-1Q9BYR8 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
KRTAP3-1Q9BYR8 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
KRTAP3-1Q9BYR8 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
KRTAP3-1Q9BYR8 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
KRTAP3-1Q9BYR8 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
KRTAP3-1Q9BYR8 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
KRTAP3-1Q9BYR8 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.05
KRTAP3-1Q9BYR8 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC8.46□□□□□ -1.05
KRTAP3-1Q9BYR8 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
KRTAP3-1Q9BYR8 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
KRTAP3-1Q9BYR8 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
KRTAP3-1Q9BYR8 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.05
KRTAP3-1Q9BYR8 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
KRTAP3-1Q9BYR8 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.05
KRTAP3-1Q9BYR8 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.05
KRTAP3-1Q9BYR8 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
KRTAP3-1Q9BYR8 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
KRTAP3-1Q9BYR8 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
KRTAP3-1Q9BYR8 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
KRTAP3-1Q9BYR8 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
KRTAP3-1Q9BYR8 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.05
KRTAP3-1Q9BYR8 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
KRTAP3-1Q9BYR8 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
KRTAP3-1Q9BYR8 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.05
KRTAP3-1Q9BYR8 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.05
KRTAP3-1Q9BYR8 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC8.46□□□□□ -1.05
KRTAP3-1Q9BYR8 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC8.46□□□□□ -1.05
KRTAP3-1Q9BYR8 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
KRTAP3-1Q9BYR8 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
KRTAP3-1Q9BYR8 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
KRTAP3-1Q9BYR8 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
KRTAP3-1Q9BYR8 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
KRTAP3-1Q9BYR8 REC114-201ENST00000331090 927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
KRTAP3-1Q9BYR8 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
KRTAP3-1Q9BYR8 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
KRTAP3-1Q9BYR8 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms