Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms