Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWC9

CCDC106, Coiled-coil domain-containing protein 106, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC106Q9BWC9 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC106Q9BWC9 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC106Q9BWC9 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC106Q9BWC9 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC106Q9BWC9 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC106Q9BWC9 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC106Q9BWC9 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC106Q9BWC9 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC106Q9BWC9 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC106Q9BWC9 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC106Q9BWC9 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC106Q9BWC9 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC106Q9BWC9 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC106Q9BWC9 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC106Q9BWC9 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC106Q9BWC9 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC106Q9BWC9 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC106Q9BWC9 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC106Q9BWC9 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC106Q9BWC9 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC106Q9BWC9 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC106Q9BWC9 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC106Q9BWC9 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC106Q9BWC9 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC106Q9BWC9 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC106Q9BWC9 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC106Q9BWC9 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC106Q9BWC9 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC106Q9BWC9 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC106Q9BWC9 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC106Q9BWC9 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC106Q9BWC9 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC106Q9BWC9 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC106Q9BWC9 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC106Q9BWC9 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC106Q9BWC9 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC106Q9BWC9 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC106Q9BWC9 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC106Q9BWC9 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC106Q9BWC9 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC106Q9BWC9 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC106Q9BWC9 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC106Q9BWC9 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC106Q9BWC9 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC106Q9BWC9 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC106Q9BWC9 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC106Q9BWC9 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC106Q9BWC9 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC106Q9BWC9 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC106Q9BWC9 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC106Q9BWC9 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC106Q9BWC9 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC106Q9BWC9 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC106Q9BWC9 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC106Q9BWC9 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC106Q9BWC9 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC106Q9BWC9 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms