Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUI4

POLR3C, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3CQ9BUI4 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
POLR3CQ9BUI4 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
POLR3CQ9BUI4 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR3CQ9BUI4 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR3CQ9BUI4 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR3CQ9BUI4 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR3CQ9BUI4 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR3CQ9BUI4 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR3CQ9BUI4 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR3CQ9BUI4 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR3CQ9BUI4 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR3CQ9BUI4 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR3CQ9BUI4 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR3CQ9BUI4 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR3CQ9BUI4 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR3CQ9BUI4 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR3CQ9BUI4 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR3CQ9BUI4 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR3CQ9BUI4 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR3CQ9BUI4 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR3CQ9BUI4 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR3CQ9BUI4 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR3CQ9BUI4 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR3CQ9BUI4 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR3CQ9BUI4 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR3CQ9BUI4 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR3CQ9BUI4 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR3CQ9BUI4 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR3CQ9BUI4 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR3CQ9BUI4 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR3CQ9BUI4 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR3CQ9BUI4 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR3CQ9BUI4 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR3CQ9BUI4 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR3CQ9BUI4 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR3CQ9BUI4 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR3CQ9BUI4 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR3CQ9BUI4 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms