Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTV4

TMEM43, Transmembrane protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM43Q9BTV4 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84 ms