Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF4

TIMM29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM29Q9BSF4 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.7 ms