Protein–RNA interactions for Protein: Q99612

KLF6, Krueppel-like factor 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF6Q99612 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLF6Q99612 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLF6Q99612 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLF6Q99612 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLF6Q99612 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLF6Q99612 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLF6Q99612 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLF6Q99612 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLF6Q99612 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLF6Q99612 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLF6Q99612 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLF6Q99612 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLF6Q99612 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLF6Q99612 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLF6Q99612 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLF6Q99612 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
KLF6Q99612 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLF6Q99612 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLF6Q99612 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLF6Q99612 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLF6Q99612 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLF6Q99612 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLF6Q99612 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLF6Q99612 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLF6Q99612 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLF6Q99612 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLF6Q99612 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLF6Q99612 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
KLF6Q99612 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLF6Q99612 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLF6Q99612 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLF6Q99612 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLF6Q99612 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLF6Q99612 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLF6Q99612 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLF6Q99612 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLF6Q99612 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
KLF6Q99612 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLF6Q99612 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLF6Q99612 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLF6Q99612 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLF6Q99612 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLF6Q99612 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLF6Q99612 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLF6Q99612 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLF6Q99612 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLF6Q99612 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLF6Q99612 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLF6Q99612 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLF6Q99612 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLF6Q99612 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLF6Q99612 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLF6Q99612 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
KLF6Q99612 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLF6Q99612 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLF6Q99612 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLF6Q99612 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLF6Q99612 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLF6Q99612 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLF6Q99612 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLF6Q99612 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLF6Q99612 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLF6Q99612 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLF6Q99612 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLF6Q99612 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLF6Q99612 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLF6Q99612 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLF6Q99612 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLF6Q99612 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLF6Q99612 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLF6Q99612 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLF6Q99612 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLF6Q99612 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
KLF6Q99612 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
KLF6Q99612 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLF6Q99612 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
KLF6Q99612 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
KLF6Q99612 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLF6Q99612 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLF6Q99612 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
KLF6Q99612 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLF6Q99612 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLF6Q99612 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLF6Q99612 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLF6Q99612 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLF6Q99612 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLF6Q99612 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLF6Q99612 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLF6Q99612 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLF6Q99612 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLF6Q99612 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLF6Q99612 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLF6Q99612 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLF6Q99612 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLF6Q99612 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLF6Q99612 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLF6Q99612 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLF6Q99612 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLF6Q99612 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLF6Q99612 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.5 ms