Protein–RNA interactions for Protein: Q96RF0

SNX18, Sorting nexin-18, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18Q96RF0 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX18Q96RF0 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms