Protein–RNA interactions for Protein: Q96M94

KLHL15, Kelch-like protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL15Q96M94 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL15Q96M94 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLHL15Q96M94 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLHL15Q96M94 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLHL15Q96M94 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLHL15Q96M94 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLHL15Q96M94 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLHL15Q96M94 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLHL15Q96M94 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLHL15Q96M94 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLHL15Q96M94 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLHL15Q96M94 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLHL15Q96M94 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLHL15Q96M94 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLHL15Q96M94 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLHL15Q96M94 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLHL15Q96M94 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLHL15Q96M94 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLHL15Q96M94 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL15Q96M94 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL15Q96M94 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL15Q96M94 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL15Q96M94 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL15Q96M94 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL15Q96M94 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL15Q96M94 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL15Q96M94 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL15Q96M94 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL15Q96M94 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL15Q96M94 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL15Q96M94 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL15Q96M94 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL15Q96M94 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL15Q96M94 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL15Q96M94 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms