Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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