Protein–RNA interactions for Protein: Q96GR4

ZDHHC12, Probable palmitoyltransferase ZDHHC12, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC12Q96GR4 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZDHHC12Q96GR4 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZDHHC12Q96GR4 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZDHHC12Q96GR4 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZDHHC12Q96GR4 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
ZDHHC12Q96GR4 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZDHHC12Q96GR4 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZDHHC12Q96GR4 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZDHHC12Q96GR4 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZDHHC12Q96GR4 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZDHHC12Q96GR4 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZDHHC12Q96GR4 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZDHHC12Q96GR4 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZDHHC12Q96GR4 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZDHHC12Q96GR4 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZDHHC12Q96GR4 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZDHHC12Q96GR4 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZDHHC12Q96GR4 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZDHHC12Q96GR4 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZDHHC12Q96GR4 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZDHHC12Q96GR4 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZDHHC12Q96GR4 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZDHHC12Q96GR4 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZDHHC12Q96GR4 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZDHHC12Q96GR4 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ZDHHC12Q96GR4 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ZDHHC12Q96GR4 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ZDHHC12Q96GR4 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZDHHC12Q96GR4 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ZDHHC12Q96GR4 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZDHHC12Q96GR4 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ZDHHC12Q96GR4 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZDHHC12Q96GR4 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZDHHC12Q96GR4 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZDHHC12Q96GR4 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZDHHC12Q96GR4 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZDHHC12Q96GR4 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZDHHC12Q96GR4 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZDHHC12Q96GR4 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ZDHHC12Q96GR4 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZDHHC12Q96GR4 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZDHHC12Q96GR4 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZDHHC12Q96GR4 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZDHHC12Q96GR4 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZDHHC12Q96GR4 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZDHHC12Q96GR4 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZDHHC12Q96GR4 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZDHHC12Q96GR4 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZDHHC12Q96GR4 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZDHHC12Q96GR4 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZDHHC12Q96GR4 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZDHHC12Q96GR4 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZDHHC12Q96GR4 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZDHHC12Q96GR4 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZDHHC12Q96GR4 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZDHHC12Q96GR4 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZDHHC12Q96GR4 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZDHHC12Q96GR4 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZDHHC12Q96GR4 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZDHHC12Q96GR4 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZDHHC12Q96GR4 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZDHHC12Q96GR4 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZDHHC12Q96GR4 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZDHHC12Q96GR4 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZDHHC12Q96GR4 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZDHHC12Q96GR4 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZDHHC12Q96GR4 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZDHHC12Q96GR4 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZDHHC12Q96GR4 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ZDHHC12Q96GR4 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZDHHC12Q96GR4 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ZDHHC12Q96GR4 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZDHHC12Q96GR4 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZDHHC12Q96GR4 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZDHHC12Q96GR4 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZDHHC12Q96GR4 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ZDHHC12Q96GR4 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ZDHHC12Q96GR4 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZDHHC12Q96GR4 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZDHHC12Q96GR4 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZDHHC12Q96GR4 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZDHHC12Q96GR4 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZDHHC12Q96GR4 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZDHHC12Q96GR4 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZDHHC12Q96GR4 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZDHHC12Q96GR4 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZDHHC12Q96GR4 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZDHHC12Q96GR4 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZDHHC12Q96GR4 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZDHHC12Q96GR4 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZDHHC12Q96GR4 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ZDHHC12Q96GR4 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZDHHC12Q96GR4 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZDHHC12Q96GR4 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZDHHC12Q96GR4 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZDHHC12Q96GR4 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZDHHC12Q96GR4 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZDHHC12Q96GR4 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZDHHC12Q96GR4 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZDHHC12Q96GR4 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.3 ms