Protein–RNA interactions for Protein: Q96CB5

C8orf44, Putative uncharacterized protein C8orf44, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf44Q96CB5 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C8orf44Q96CB5 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C8orf44Q96CB5 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C8orf44Q96CB5 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C8orf44Q96CB5 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
C8orf44Q96CB5 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C8orf44Q96CB5 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C8orf44Q96CB5 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C8orf44Q96CB5 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C8orf44Q96CB5 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C8orf44Q96CB5 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C8orf44Q96CB5 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C8orf44Q96CB5 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C8orf44Q96CB5 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C8orf44Q96CB5 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C8orf44Q96CB5 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C8orf44Q96CB5 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
C8orf44Q96CB5 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C8orf44Q96CB5 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C8orf44Q96CB5 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C8orf44Q96CB5 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C8orf44Q96CB5 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C8orf44Q96CB5 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C8orf44Q96CB5 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C8orf44Q96CB5 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C8orf44Q96CB5 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C8orf44Q96CB5 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C8orf44Q96CB5 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C8orf44Q96CB5 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C8orf44Q96CB5 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C8orf44Q96CB5 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C8orf44Q96CB5 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C8orf44Q96CB5 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C8orf44Q96CB5 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C8orf44Q96CB5 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
C8orf44Q96CB5 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C8orf44Q96CB5 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C8orf44Q96CB5 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C8orf44Q96CB5 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C8orf44Q96CB5 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C8orf44Q96CB5 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C8orf44Q96CB5 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C8orf44Q96CB5 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C8orf44Q96CB5 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
C8orf44Q96CB5 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C8orf44Q96CB5 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C8orf44Q96CB5 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C8orf44Q96CB5 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C8orf44Q96CB5 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C8orf44Q96CB5 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C8orf44Q96CB5 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C8orf44Q96CB5 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C8orf44Q96CB5 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C8orf44Q96CB5 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
C8orf44Q96CB5 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
C8orf44Q96CB5 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C8orf44Q96CB5 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C8orf44Q96CB5 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C8orf44Q96CB5 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
C8orf44Q96CB5 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C8orf44Q96CB5 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C8orf44Q96CB5 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C8orf44Q96CB5 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C8orf44Q96CB5 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
C8orf44Q96CB5 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
C8orf44Q96CB5 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C8orf44Q96CB5 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C8orf44Q96CB5 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
C8orf44Q96CB5 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C8orf44Q96CB5 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C8orf44Q96CB5 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C8orf44Q96CB5 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C8orf44Q96CB5 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C8orf44Q96CB5 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C8orf44Q96CB5 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C8orf44Q96CB5 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C8orf44Q96CB5 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C8orf44Q96CB5 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C8orf44Q96CB5 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C8orf44Q96CB5 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C8orf44Q96CB5 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C8orf44Q96CB5 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C8orf44Q96CB5 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C8orf44Q96CB5 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C8orf44Q96CB5 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C8orf44Q96CB5 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C8orf44Q96CB5 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C8orf44Q96CB5 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C8orf44Q96CB5 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C8orf44Q96CB5 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C8orf44Q96CB5 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C8orf44Q96CB5 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C8orf44Q96CB5 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C8orf44Q96CB5 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C8orf44Q96CB5 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C8orf44Q96CB5 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C8orf44Q96CB5 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C8orf44Q96CB5 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C8orf44Q96CB5 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C8orf44Q96CB5 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms