Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 149.2 ms