Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms