Protein–RNA interactions for Protein: Q92743

HTRA1, Serine protease HTRA1, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA1Q92743 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTRA1Q92743 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTRA1Q92743 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTRA1Q92743 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTRA1Q92743 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTRA1Q92743 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTRA1Q92743 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTRA1Q92743 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTRA1Q92743 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTRA1Q92743 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTRA1Q92743 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTRA1Q92743 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTRA1Q92743 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTRA1Q92743 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTRA1Q92743 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTRA1Q92743 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTRA1Q92743 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTRA1Q92743 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HTRA1Q92743 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms