Protein–RNA interactions for Protein: Q92485

SMPDL3B, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPDL3BQ92485 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms