Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD5

MCOLN3, Mucolipin-3, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCOLN3Q8TDD5 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MCOLN3Q8TDD5 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MCOLN3Q8TDD5 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MCOLN3Q8TDD5 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MCOLN3Q8TDD5 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MCOLN3Q8TDD5 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms