Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V6

ANKRD53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD53Q8N9V6 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ANKRD53Q8N9V6 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ANKRD53Q8N9V6 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ANKRD53Q8N9V6 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ANKRD53Q8N9V6 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ANKRD53Q8N9V6 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ANKRD53Q8N9V6 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ANKRD53Q8N9V6 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ANKRD53Q8N9V6 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ANKRD53Q8N9V6 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ANKRD53Q8N9V6 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ANKRD53Q8N9V6 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ANKRD53Q8N9V6 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ANKRD53Q8N9V6 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ANKRD53Q8N9V6 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ANKRD53Q8N9V6 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ANKRD53Q8N9V6 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ANKRD53Q8N9V6 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ANKRD53Q8N9V6 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ANKRD53Q8N9V6 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ANKRD53Q8N9V6 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ANKRD53Q8N9V6 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ANKRD53Q8N9V6 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ANKRD53Q8N9V6 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ANKRD53Q8N9V6 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ANKRD53Q8N9V6 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ANKRD53Q8N9V6 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ANKRD53Q8N9V6 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD53Q8N9V6 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD53Q8N9V6 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD53Q8N9V6 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD53Q8N9V6 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD53Q8N9V6 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD53Q8N9V6 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD53Q8N9V6 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD53Q8N9V6 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD53Q8N9V6 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD53Q8N9V6 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD53Q8N9V6 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD53Q8N9V6 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD53Q8N9V6 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD53Q8N9V6 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD53Q8N9V6 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD53Q8N9V6 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD53Q8N9V6 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD53Q8N9V6 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD53Q8N9V6 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD53Q8N9V6 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD53Q8N9V6 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD53Q8N9V6 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD53Q8N9V6 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD53Q8N9V6 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD53Q8N9V6 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD53Q8N9V6 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD53Q8N9V6 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD53Q8N9V6 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD53Q8N9V6 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD53Q8N9V6 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD53Q8N9V6 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD53Q8N9V6 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD53Q8N9V6 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD53Q8N9V6 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD53Q8N9V6 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD53Q8N9V6 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD53Q8N9V6 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD53Q8N9V6 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD53Q8N9V6 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD53Q8N9V6 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ANKRD53Q8N9V6 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ANKRD53Q8N9V6 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ANKRD53Q8N9V6 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ANKRD53Q8N9V6 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ANKRD53Q8N9V6 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ANKRD53Q8N9V6 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ANKRD53Q8N9V6 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ANKRD53Q8N9V6 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ANKRD53Q8N9V6 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ANKRD53Q8N9V6 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ANKRD53Q8N9V6 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ANKRD53Q8N9V6 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ANKRD53Q8N9V6 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ANKRD53Q8N9V6 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ANKRD53Q8N9V6 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ANKRD53Q8N9V6 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ANKRD53Q8N9V6 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ANKRD53Q8N9V6 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ANKRD53Q8N9V6 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ANKRD53Q8N9V6 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ANKRD53Q8N9V6 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ANKRD53Q8N9V6 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ANKRD53Q8N9V6 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ANKRD53Q8N9V6 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ANKRD53Q8N9V6 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ANKRD53Q8N9V6 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ANKRD53Q8N9V6 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ANKRD53Q8N9V6 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ANKRD53Q8N9V6 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ANKRD53Q8N9V6 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ANKRD53Q8N9V6 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ANKRD53Q8N9V6 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms