Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F7

GCSAM, Germinal center-associated signaling and motility protein, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSAMQ8N6F7 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
GCSAMQ8N6F7 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
GCSAMQ8N6F7 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
GCSAMQ8N6F7 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
GCSAMQ8N6F7 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
GCSAMQ8N6F7 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
GCSAMQ8N6F7 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
GCSAMQ8N6F7 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
GCSAMQ8N6F7 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
GCSAMQ8N6F7 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
GCSAMQ8N6F7 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
GCSAMQ8N6F7 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
GCSAMQ8N6F7 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
GCSAMQ8N6F7 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
GCSAMQ8N6F7 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
GCSAMQ8N6F7 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
GCSAMQ8N6F7 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
GCSAMQ8N6F7 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
GCSAMQ8N6F7 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
GCSAMQ8N6F7 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
GCSAMQ8N6F7 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
GCSAMQ8N6F7 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
GCSAMQ8N6F7 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
GCSAMQ8N6F7 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
GCSAMQ8N6F7 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
GCSAMQ8N6F7 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
GCSAMQ8N6F7 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
GCSAMQ8N6F7 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
GCSAMQ8N6F7 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
GCSAMQ8N6F7 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
GCSAMQ8N6F7 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
GCSAMQ8N6F7 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
GCSAMQ8N6F7 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
GCSAMQ8N6F7 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
GCSAMQ8N6F7 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
GCSAMQ8N6F7 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
GCSAMQ8N6F7 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
GCSAMQ8N6F7 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
GCSAMQ8N6F7 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
GCSAMQ8N6F7 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
GCSAMQ8N6F7 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
GCSAMQ8N6F7 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
GCSAMQ8N6F7 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
GCSAMQ8N6F7 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
GCSAMQ8N6F7 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
GCSAMQ8N6F7 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
GCSAMQ8N6F7 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
GCSAMQ8N6F7 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
GCSAMQ8N6F7 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC14□□□□□ -0.17
GCSAMQ8N6F7 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
GCSAMQ8N6F7 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
GCSAMQ8N6F7 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
GCSAMQ8N6F7 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
GCSAMQ8N6F7 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
GCSAMQ8N6F7 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
GCSAMQ8N6F7 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
GCSAMQ8N6F7 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
GCSAMQ8N6F7 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
GCSAMQ8N6F7 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
GCSAMQ8N6F7 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
GCSAMQ8N6F7 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
GCSAMQ8N6F7 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
GCSAMQ8N6F7 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
GCSAMQ8N6F7 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
GCSAMQ8N6F7 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
GCSAMQ8N6F7 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
GCSAMQ8N6F7 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
GCSAMQ8N6F7 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
GCSAMQ8N6F7 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
GCSAMQ8N6F7 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
GCSAMQ8N6F7 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
GCSAMQ8N6F7 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
GCSAMQ8N6F7 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
GCSAMQ8N6F7 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
GCSAMQ8N6F7 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
GCSAMQ8N6F7 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
GCSAMQ8N6F7 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
GCSAMQ8N6F7 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
GCSAMQ8N6F7 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
GCSAMQ8N6F7 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
GCSAMQ8N6F7 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
GCSAMQ8N6F7 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
GCSAMQ8N6F7 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
GCSAMQ8N6F7 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
GCSAMQ8N6F7 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
GCSAMQ8N6F7 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
GCSAMQ8N6F7 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
GCSAMQ8N6F7 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
GCSAMQ8N6F7 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
GCSAMQ8N6F7 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
GCSAMQ8N6F7 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
GCSAMQ8N6F7 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
GCSAMQ8N6F7 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
GCSAMQ8N6F7 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
GCSAMQ8N6F7 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
GCSAMQ8N6F7 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
GCSAMQ8N6F7 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
GCSAMQ8N6F7 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
GCSAMQ8N6F7 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
GCSAMQ8N6F7 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms