Protein–RNA interactions for Protein: Q8N448

LNX2, Ligand of Numb protein X 2, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNX2Q8N448 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LNX2Q8N448 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LNX2Q8N448 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LNX2Q8N448 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LNX2Q8N448 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LNX2Q8N448 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LNX2Q8N448 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LNX2Q8N448 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LNX2Q8N448 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LNX2Q8N448 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LNX2Q8N448 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LNX2Q8N448 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LNX2Q8N448 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LNX2Q8N448 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LNX2Q8N448 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LNX2Q8N448 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LNX2Q8N448 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LNX2Q8N448 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms