Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3Z3

GTPBP8, GTP-binding protein 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP8Q8N3Z3 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GTPBP8Q8N3Z3 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GTPBP8Q8N3Z3 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GTPBP8Q8N3Z3 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GTPBP8Q8N3Z3 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GTPBP8Q8N3Z3 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GTPBP8Q8N3Z3 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GTPBP8Q8N3Z3 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GTPBP8Q8N3Z3 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GTPBP8Q8N3Z3 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GTPBP8Q8N3Z3 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GTPBP8Q8N3Z3 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GTPBP8Q8N3Z3 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GTPBP8Q8N3Z3 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GTPBP8Q8N3Z3 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GTPBP8Q8N3Z3 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GTPBP8Q8N3Z3 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GTPBP8Q8N3Z3 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GTPBP8Q8N3Z3 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GTPBP8Q8N3Z3 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GTPBP8Q8N3Z3 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GTPBP8Q8N3Z3 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GTPBP8Q8N3Z3 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GTPBP8Q8N3Z3 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GTPBP8Q8N3Z3 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GTPBP8Q8N3Z3 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GTPBP8Q8N3Z3 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GTPBP8Q8N3Z3 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GTPBP8Q8N3Z3 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GTPBP8Q8N3Z3 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GTPBP8Q8N3Z3 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GTPBP8Q8N3Z3 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GTPBP8Q8N3Z3 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GTPBP8Q8N3Z3 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GTPBP8Q8N3Z3 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GTPBP8Q8N3Z3 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GTPBP8Q8N3Z3 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GTPBP8Q8N3Z3 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GTPBP8Q8N3Z3 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GTPBP8Q8N3Z3 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GTPBP8Q8N3Z3 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GTPBP8Q8N3Z3 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GTPBP8Q8N3Z3 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GTPBP8Q8N3Z3 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GTPBP8Q8N3Z3 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GTPBP8Q8N3Z3 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GTPBP8Q8N3Z3 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GTPBP8Q8N3Z3 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GTPBP8Q8N3Z3 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GTPBP8Q8N3Z3 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GTPBP8Q8N3Z3 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GTPBP8Q8N3Z3 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GTPBP8Q8N3Z3 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GTPBP8Q8N3Z3 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GTPBP8Q8N3Z3 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GTPBP8Q8N3Z3 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GTPBP8Q8N3Z3 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GTPBP8Q8N3Z3 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GTPBP8Q8N3Z3 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GTPBP8Q8N3Z3 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GTPBP8Q8N3Z3 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GTPBP8Q8N3Z3 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GTPBP8Q8N3Z3 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GTPBP8Q8N3Z3 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GTPBP8Q8N3Z3 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GTPBP8Q8N3Z3 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GTPBP8Q8N3Z3 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GTPBP8Q8N3Z3 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GTPBP8Q8N3Z3 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GTPBP8Q8N3Z3 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GTPBP8Q8N3Z3 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GTPBP8Q8N3Z3 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GTPBP8Q8N3Z3 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GTPBP8Q8N3Z3 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GTPBP8Q8N3Z3 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GTPBP8Q8N3Z3 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GTPBP8Q8N3Z3 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GTPBP8Q8N3Z3 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GTPBP8Q8N3Z3 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GTPBP8Q8N3Z3 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GTPBP8Q8N3Z3 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GTPBP8Q8N3Z3 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GTPBP8Q8N3Z3 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GTPBP8Q8N3Z3 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GTPBP8Q8N3Z3 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GTPBP8Q8N3Z3 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GTPBP8Q8N3Z3 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GTPBP8Q8N3Z3 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GTPBP8Q8N3Z3 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GTPBP8Q8N3Z3 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GTPBP8Q8N3Z3 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GTPBP8Q8N3Z3 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GTPBP8Q8N3Z3 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GTPBP8Q8N3Z3 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GTPBP8Q8N3Z3 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GTPBP8Q8N3Z3 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GTPBP8Q8N3Z3 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GTPBP8Q8N3Z3 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GTPBP8Q8N3Z3 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GTPBP8Q8N3Z3 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms