Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVB5

LIX1L, LIX1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIX1LQ8IVB5 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIX1LQ8IVB5 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIX1LQ8IVB5 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIX1LQ8IVB5 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIX1LQ8IVB5 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIX1LQ8IVB5 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIX1LQ8IVB5 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIX1LQ8IVB5 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LIX1LQ8IVB5 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LIX1LQ8IVB5 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LIX1LQ8IVB5 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LIX1LQ8IVB5 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LIX1LQ8IVB5 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LIX1LQ8IVB5 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LIX1LQ8IVB5 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LIX1LQ8IVB5 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LIX1LQ8IVB5 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LIX1LQ8IVB5 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LIX1LQ8IVB5 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LIX1LQ8IVB5 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LIX1LQ8IVB5 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LIX1LQ8IVB5 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LIX1LQ8IVB5 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LIX1LQ8IVB5 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LIX1LQ8IVB5 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LIX1LQ8IVB5 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LIX1LQ8IVB5 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LIX1LQ8IVB5 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LIX1LQ8IVB5 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LIX1LQ8IVB5 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LIX1LQ8IVB5 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LIX1LQ8IVB5 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LIX1LQ8IVB5 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LIX1LQ8IVB5 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LIX1LQ8IVB5 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LIX1LQ8IVB5 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LIX1LQ8IVB5 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LIX1LQ8IVB5 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LIX1LQ8IVB5 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LIX1LQ8IVB5 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LIX1LQ8IVB5 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LIX1LQ8IVB5 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LIX1LQ8IVB5 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LIX1LQ8IVB5 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LIX1LQ8IVB5 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LIX1LQ8IVB5 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LIX1LQ8IVB5 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LIX1LQ8IVB5 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIX1LQ8IVB5 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIX1LQ8IVB5 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIX1LQ8IVB5 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIX1LQ8IVB5 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIX1LQ8IVB5 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIX1LQ8IVB5 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIX1LQ8IVB5 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIX1LQ8IVB5 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIX1LQ8IVB5 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIX1LQ8IVB5 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIX1LQ8IVB5 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIX1LQ8IVB5 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIX1LQ8IVB5 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIX1LQ8IVB5 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIX1LQ8IVB5 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIX1LQ8IVB5 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIX1LQ8IVB5 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIX1LQ8IVB5 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIX1LQ8IVB5 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIX1LQ8IVB5 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIX1LQ8IVB5 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIX1LQ8IVB5 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIX1LQ8IVB5 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIX1LQ8IVB5 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LIX1LQ8IVB5 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIX1LQ8IVB5 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIX1LQ8IVB5 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LIX1LQ8IVB5 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIX1LQ8IVB5 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIX1LQ8IVB5 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIX1LQ8IVB5 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIX1LQ8IVB5 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIX1LQ8IVB5 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIX1LQ8IVB5 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIX1LQ8IVB5 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIX1LQ8IVB5 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIX1LQ8IVB5 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIX1LQ8IVB5 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIX1LQ8IVB5 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIX1LQ8IVB5 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIX1LQ8IVB5 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LIX1LQ8IVB5 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LIX1LQ8IVB5 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LIX1LQ8IVB5 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LIX1LQ8IVB5 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LIX1LQ8IVB5 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LIX1LQ8IVB5 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LIX1LQ8IVB5 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LIX1LQ8IVB5 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LIX1LQ8IVB5 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LIX1LQ8IVB5 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LIX1LQ8IVB5 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms