Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms