Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTW8

OTOA, Otoancorin, humanhuman

Predictions only

Length 1,153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOAQ7RTW8 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
OTOAQ7RTW8 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
OTOAQ7RTW8 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
OTOAQ7RTW8 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
OTOAQ7RTW8 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
OTOAQ7RTW8 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
OTOAQ7RTW8 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
OTOAQ7RTW8 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
OTOAQ7RTW8 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
OTOAQ7RTW8 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
OTOAQ7RTW8 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
OTOAQ7RTW8 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
OTOAQ7RTW8 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
OTOAQ7RTW8 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
OTOAQ7RTW8 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
OTOAQ7RTW8 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
OTOAQ7RTW8 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
OTOAQ7RTW8 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
OTOAQ7RTW8 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
OTOAQ7RTW8 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
OTOAQ7RTW8 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
OTOAQ7RTW8 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
OTOAQ7RTW8 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
OTOAQ7RTW8 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
OTOAQ7RTW8 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
OTOAQ7RTW8 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
OTOAQ7RTW8 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
OTOAQ7RTW8 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
OTOAQ7RTW8 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
OTOAQ7RTW8 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
OTOAQ7RTW8 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
OTOAQ7RTW8 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
OTOAQ7RTW8 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
OTOAQ7RTW8 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
OTOAQ7RTW8 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
OTOAQ7RTW8 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
OTOAQ7RTW8 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
OTOAQ7RTW8 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
OTOAQ7RTW8 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
OTOAQ7RTW8 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
OTOAQ7RTW8 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
OTOAQ7RTW8 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
OTOAQ7RTW8 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
OTOAQ7RTW8 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
OTOAQ7RTW8 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
OTOAQ7RTW8 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
OTOAQ7RTW8 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
OTOAQ7RTW8 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
OTOAQ7RTW8 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
OTOAQ7RTW8 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
OTOAQ7RTW8 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
OTOAQ7RTW8 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
OTOAQ7RTW8 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
OTOAQ7RTW8 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
OTOAQ7RTW8 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
OTOAQ7RTW8 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
OTOAQ7RTW8 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
OTOAQ7RTW8 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
OTOAQ7RTW8 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
OTOAQ7RTW8 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
OTOAQ7RTW8 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
OTOAQ7RTW8 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
OTOAQ7RTW8 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
OTOAQ7RTW8 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
OTOAQ7RTW8 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
OTOAQ7RTW8 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
OTOAQ7RTW8 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
OTOAQ7RTW8 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
OTOAQ7RTW8 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
OTOAQ7RTW8 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
OTOAQ7RTW8 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
OTOAQ7RTW8 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
OTOAQ7RTW8 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
OTOAQ7RTW8 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
OTOAQ7RTW8 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
OTOAQ7RTW8 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
OTOAQ7RTW8 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
OTOAQ7RTW8 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
OTOAQ7RTW8 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
OTOAQ7RTW8 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
OTOAQ7RTW8 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
OTOAQ7RTW8 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
OTOAQ7RTW8 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
OTOAQ7RTW8 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
OTOAQ7RTW8 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
OTOAQ7RTW8 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
OTOAQ7RTW8 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
OTOAQ7RTW8 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
OTOAQ7RTW8 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
OTOAQ7RTW8 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
OTOAQ7RTW8 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
OTOAQ7RTW8 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
OTOAQ7RTW8 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
OTOAQ7RTW8 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
OTOAQ7RTW8 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
OTOAQ7RTW8 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
OTOAQ7RTW8 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
OTOAQ7RTW8 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
OTOAQ7RTW8 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
OTOAQ7RTW8 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms