Protein–RNA interactions for Protein: Q76M96

CCDC80, Coiled-coil domain-containing protein 80, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC80Q76M96 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms