Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms