Protein–RNA interactions for Protein: Q58WW2

DCAF6, DDB1- and CUL4-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF6Q58WW2 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DCAF6Q58WW2 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DCAF6Q58WW2 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
DCAF6Q58WW2 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
DCAF6Q58WW2 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
DCAF6Q58WW2 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
DCAF6Q58WW2 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
DCAF6Q58WW2 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DCAF6Q58WW2 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DCAF6Q58WW2 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DCAF6Q58WW2 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DCAF6Q58WW2 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DCAF6Q58WW2 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DCAF6Q58WW2 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DCAF6Q58WW2 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DCAF6Q58WW2 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DCAF6Q58WW2 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DCAF6Q58WW2 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DCAF6Q58WW2 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DCAF6Q58WW2 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DCAF6Q58WW2 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DCAF6Q58WW2 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DCAF6Q58WW2 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DCAF6Q58WW2 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DCAF6Q58WW2 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
DCAF6Q58WW2 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
DCAF6Q58WW2 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DCAF6Q58WW2 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DCAF6Q58WW2 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DCAF6Q58WW2 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DCAF6Q58WW2 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DCAF6Q58WW2 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DCAF6Q58WW2 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DCAF6Q58WW2 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DCAF6Q58WW2 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DCAF6Q58WW2 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DCAF6Q58WW2 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DCAF6Q58WW2 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DCAF6Q58WW2 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DCAF6Q58WW2 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DCAF6Q58WW2 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DCAF6Q58WW2 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DCAF6Q58WW2 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DCAF6Q58WW2 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DCAF6Q58WW2 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DCAF6Q58WW2 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DCAF6Q58WW2 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DCAF6Q58WW2 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DCAF6Q58WW2 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
DCAF6Q58WW2 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DCAF6Q58WW2 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DCAF6Q58WW2 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DCAF6Q58WW2 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DCAF6Q58WW2 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DCAF6Q58WW2 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DCAF6Q58WW2 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DCAF6Q58WW2 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DCAF6Q58WW2 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DCAF6Q58WW2 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DCAF6Q58WW2 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DCAF6Q58WW2 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DCAF6Q58WW2 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DCAF6Q58WW2 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DCAF6Q58WW2 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DCAF6Q58WW2 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DCAF6Q58WW2 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DCAF6Q58WW2 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DCAF6Q58WW2 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DCAF6Q58WW2 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DCAF6Q58WW2 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DCAF6Q58WW2 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DCAF6Q58WW2 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DCAF6Q58WW2 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DCAF6Q58WW2 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DCAF6Q58WW2 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DCAF6Q58WW2 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DCAF6Q58WW2 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DCAF6Q58WW2 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DCAF6Q58WW2 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DCAF6Q58WW2 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DCAF6Q58WW2 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DCAF6Q58WW2 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DCAF6Q58WW2 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DCAF6Q58WW2 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DCAF6Q58WW2 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DCAF6Q58WW2 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DCAF6Q58WW2 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DCAF6Q58WW2 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DCAF6Q58WW2 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DCAF6Q58WW2 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DCAF6Q58WW2 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DCAF6Q58WW2 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DCAF6Q58WW2 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DCAF6Q58WW2 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DCAF6Q58WW2 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DCAF6Q58WW2 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DCAF6Q58WW2 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DCAF6Q58WW2 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DCAF6Q58WW2 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DCAF6Q58WW2 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms