Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.9 ms