Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB6CQ53S08 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB6CQ53S08 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB6CQ53S08 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB6CQ53S08 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB6CQ53S08 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB6CQ53S08 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB6CQ53S08 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB6CQ53S08 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB6CQ53S08 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB6CQ53S08 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB6CQ53S08 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB6CQ53S08 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB6CQ53S08 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB6CQ53S08 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB6CQ53S08 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB6CQ53S08 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB6CQ53S08 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB6CQ53S08 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB6CQ53S08 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB6CQ53S08 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB6CQ53S08 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB6CQ53S08 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB6CQ53S08 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB6CQ53S08 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB6CQ53S08 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB6CQ53S08 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB6CQ53S08 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB6CQ53S08 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB6CQ53S08 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB6CQ53S08 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB6CQ53S08 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB6CQ53S08 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB6CQ53S08 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB6CQ53S08 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB6CQ53S08 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB6CQ53S08 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB6CQ53S08 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB6CQ53S08 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB6CQ53S08 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB6CQ53S08 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB6CQ53S08 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB6CQ53S08 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB6CQ53S08 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB6CQ53S08 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB6CQ53S08 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB6CQ53S08 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB6CQ53S08 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB6CQ53S08 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB6CQ53S08 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB6CQ53S08 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB6CQ53S08 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB6CQ53S08 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB6CQ53S08 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB6CQ53S08 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB6CQ53S08 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB6CQ53S08 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB6CQ53S08 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB6CQ53S08 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB6CQ53S08 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB6CQ53S08 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB6CQ53S08 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB6CQ53S08 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB6CQ53S08 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB6CQ53S08 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB6CQ53S08 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB6CQ53S08 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB6CQ53S08 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB6CQ53S08 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB6CQ53S08 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB6CQ53S08 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB6CQ53S08 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB6CQ53S08 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB6CQ53S08 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB6CQ53S08 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB6CQ53S08 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB6CQ53S08 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB6CQ53S08 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB6CQ53S08 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB6CQ53S08 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB6CQ53S08 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB6CQ53S08 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB6CQ53S08 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB6CQ53S08 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB6CQ53S08 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB6CQ53S08 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB6CQ53S08 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB6CQ53S08 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB6CQ53S08 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB6CQ53S08 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB6CQ53S08 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB6CQ53S08 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB6CQ53S08 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB6CQ53S08 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB6CQ53S08 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB6CQ53S08 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB6CQ53S08 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB6CQ53S08 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB6CQ53S08 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB6CQ53S08 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms