Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms