Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYB3

FOXD4L6, Forkhead box protein D4-like 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L6Q3SYB3 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms